关于使徒行传 2.41所提到的洗礼在何处施行，学界存有争议，因为路加没有给出任何确切的说明。人们提出了几种假说，但有些看起来比另一些更为可信。
毕士大池还是西罗亚池？
有些作者提出是毕士大池（约翰福音 5.1）或池（约翰福音 9.7）。然而，这些蓄水池并非专为礼仪洁净而设，要容纳数百乃至数千人，进入也很不方便。
圣殿周围的洁净浴池
如今历史学家和考古学家普遍倾向的假说，涉及圣殿广场周围的许多洁净浴池（mikvaot），即犹太人的礼仪浴池。
在圣殿山南面和西面进行的发掘，已发现了几十个这样的水池。它们用于进入圣殿之前律法所规定的洁净礼。上耶路撒冷守大节的朝圣者经常使用它们。
这些设施有几个优点：
- 它们本来就蓄满了水；
- 它们数量众多；
- 它们可以同时容纳大批人；
- 它们就在使徒们很可能教导人的地方的近旁（使徒行传 2.46；使徒行传 3.1）。
因此，如果洗礼确实从五旬节就开始施行，那么圣殿的洁净浴池（mikvaot）就是最自然的假说。
洗礼可能分散在若干天内
然而，仍须谨慎。路加既没有说明地点，也没有说明头一天受洗的确切人数，更没有说明这些洗礼施行的确切时间（使徒行传 2.41）。因此，洗礼有可能是在几天之内陆续进行的。
若是如此，耶路撒冷的许多洁净浴池，以及城中其他可用的水源，就有可能被陆续使用。
另一种可能：门徒们自己
五旬节时在场的一百二十名门徒（使徒行传 1.15）也可以参与施行洗礼。经文中没有任何地方迫使我们认为，是十二使徒独自为所有新信徒施洗。
结论
从历史角度看，最可能的解释是：洗礼是在圣殿附近的洁净浴池（mikvaot）中施行的，那里正是最初的基督徒惯常聚会的地方（使徒行传 2.46；使徒行传 5.12）。然而，路加的叙述不容许我们断言这三千人全都立即受了洗，也不容许断言这些洗礼是在同一个地点施行的。
如果使徒行传 2.41所提到的洗礼确实从五旬节就开始施行，那么圣殿周围的许多洁净浴池便是最可能的地点。然而，路加在这一点上保持沉默，使人不能作出任何断然的断言。
这种谨慎尤其有道理，因为与后来的某些事件（使徒行传 8.38；使徒行传 16.33）不同，路加并不认为有必要描述这些洗礼的具体做法，他主要关心的是强调初生教会的迅速扩展。