Podemos afirmar razoavelmente que se trata dos Doze e não exclusivamente de Pedro e João. Eis por quê:
Argumentos textuais
1- O contexto imediato: Em Atos 5.12, Lucas precisa que “pelas mãos dos apóstolos” (no plural geral) se faziam muitos milagres, e que todos estavam juntos no pórtico de Salomão.
2- Os versículos 5.17-18: O sumo sacerdote e os “prenderam os apóstolos (τοὺς ἀποστόλους) e os lançaram na prisão pública”. O artigo definido “os” e o plural sugerem um grupo, não somente dois indivíduos.
3- O versículo 5.29: “Pedro e os apóstolos responderam...” Essa formulação distingue Pedro como porta-voz, mas confirma a presença dos demais apóstolos.
4- O versículo 5.42: Depois de libertados, “não cessavam de ensinar” — sempre no plural coletivo.
Contraste com Atos 4
Em Atos 4.1-3, Lucas havia sido explícito: “Enquanto eles falavam ao povo, sobrevieram os sacerdotes... Lançaram mão deles” — o “deles” referindo-se claramente a Pedro e João, nomeados no capítulo 3.
Se Lucas quisesse designar apenas Pedro e João em Atos 5.18, provavelmente teria usado a mesma precisão do capítulo 4, ou mencionado seus nomes.
Conclusão
O emprego do termo geral “os apóstolos” em Atos 5.18, sem restrição nominal, indica verossimilmente que, desta vez, os Doze foram presos em conjunto, o que marca uma escalada na repressão em relação à prisão de Pedro e João somente, em Atos 4.